Le plateau bioinformatique  i-Trop – Plantes / Santé – met à disposition des ressources pour les 4 unités de recherche suivantes et leurs partenaires au Sud :

Ce plateau répond à 3 besoins en informatique pour la science :

• Calcul Haute Performance pour le traitement de données (bioinformatique, modélisation) avec un cluster de 26 noeuds de calcul ;
• Applications informatiques pour la science (bases de données sur les essais et études cliniques sur le VIH et Ebola, bases de données sur le café, le riz, les collections d’insectes, pour la gestion des échantillons biologiques de laboratoires, sites web, etc.) ;
• Formation en bioinformatique et écoles thématiques au Sud.

Actuellement, cette plateforme est gérée et animée par un administrateur système (Ndomassi TANDO), 4 bioinformaticiennes (Aurore COMTE, Valérie NOEL, Julie ORJUELA et Christine TRANCHANT-DUBREUIL) et un ingénieur spécialisé dans les systèmes d’information pour la science (Bruno GRANOUILLAC).

Elle héberge plus de 150 outils bioinformatiques et applications scientifiques pour la science.

Elle est utilisée par plus de 150 scientifiques.

L’unité est également :

•  Centre de référence OMS pour la surveillance des résistances du VIH aux anti-rétroviraux, niveau spécialisé depuis 2008
  Web : https://www.who.int/teams/global-hiv-hepatitis-and-stis-programmes/hiv/treatment/hiv-drug-resistance/laboratory-network
•  Centre de référence FAO pour les coronavirus zoonotiques depuis 2023
  Web : https://www.fao.org/animal-health/fao-reference-centres/
•  Membre du réseau CoVinet de l’OMS pour la surveillance des coronavirus à potentiel épidémique depuis 2024
  Web : https://www.who.int/groups/who-coronavirus-network

Contact : bioinfo@ird.fr ou bruno.granouillac@ird.fr